Branko Rihtman
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Eukaryote growing prokaryotes so I can infect them with phages. 2024 BBSRC Fellow at the University of Warwick. Unapologetically leftist.
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Voir le postHow can an unknown #bacteriophage be classified? A new guide presents 10 practical tips, covering genome quality, taxonomic tools, similarity searches, phylogenetics, protein structure, host range and ecology. 🦠🔬 #Virology 📄 https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1014403 👤 EVBC member: Colin Hill
Voir le postRiboseek is a fast RNA/DNA search. More sensitive than nhmmer at 250x speed. Structure-aware realignment produces MSAs approaching rMSA quality. Plus 1.7M precomputed RNA MSAs, and an API to search your own 📄 www.biorxiv.org/content/10.6... 💾 github.com/steineggerla... 🌐 search.foldseek.com/riboseek
Voir le postOur paper out in Science today: The Metis defense system senses molecular byproducts released when a phage degrades the bacterial genome, and then prevents replication of the phage in the infected cell Congratulations @ostermanilya.bsky.social and co-authors!
Voir le postThat @naomialderman.bsky.social is so fucking brilliant. If you've found yourself falling out the reading habit, she has created a kind of Couch-to-5K of reading open.substack.com/pub/naomiald...
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