Bilal Sharif
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Postdoc at Centre for Palaeogenetics, Stockholm Lead computational biologist at GenomeVault, Stockholm
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I have a hunch this moved VERY fast, given changes in GPU infrastructure that’s coming in the future.
Ver postWell done!!!
Ver postThis work was led by the amazing @bilalbioinfo.bsky.social, with massive help from Krister Hedfors, @tvdvalk.bsky.social and @palaeopete.bsky.social Feedback on G-ALN (pronunced as ”gallon”) would be highly appreciated 🙏
Ver post🚨 Ancient DNA Alert 🚨 Do you depend on BWA aln, and worry that the world’s HPC clusters are pivoting towards GPUs? Fear no more! We here present G-ALN, a GPU implementation that is >6 times faster and produces byte-identical outputs to BWA aln! www.biorxiv.org/content/10.6...
Ver postG-ALN: a GPU-accelerated BWA-aln algorithm for palaeogenomics https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.18.759956v1
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