Alison Chaves
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Doing proteomics until I still can. https://github.com/41ison
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Alison Chaves (@alisonchaves.bsky.social) ist seit 29 Oktober 2023 auf Bluesky. Das Konto hat 228 Follower, folgt 263 Konten und hat 499 Posts veröffentlicht.
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What if de novo peptide sequencing uses a proteome as a guide without being constrained by it? Unlike DB search, PepPr, a peptide language model improves variant peptide identification and enhances AB sequencing hypervariable regions. Preprint by the Gagneur lab: www.biorxiv.org/content/10.6...
Post anzeigenTime for the red-back spider glycome and glycoproteome @proteomicsnews.bsky.social?
Post anzeigenUMAP was introduced to biology data with the argument that it 'preserves the global structure of the data' better than t-SNE. The claim was falsified in this matters arising article. 1/
Post anzeigenThe matters arising article showed that the alleged superiority of UMAP can be explained by different choices of initialization: 🔷 Initialization is critical for preserving global data structure in both t-SNE and UMAP 2/ www.nature.com/articles/s41...
Post anzeigenThank you for making such a nice dataset!! It really does a nice job of showing the tradeoffs with window size and quant
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